Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP38Q8NB14 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms