Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIML1Q8N9V2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIML1Q8N9V2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms