Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
IGSF1Q8N6C5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGSF1Q8N6C5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 699.7 ms