Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PELI3Q8N2H9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PELI3Q8N2H9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms