Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00528Q8N1L1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00528Q8N1L1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00528Q8N1L1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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LINC00528Q8N1L1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00528Q8N1L1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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