Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4X1Q8N118 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CYP4X1Q8N118 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP4X1Q8N118 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms