Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPICE1Q8N0Z3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPICE1Q8N0Z3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms