Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLFN12Q8IYM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLFN12Q8IYM2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms