Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPA1Q8IWL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPA1Q8IWL2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPA1Q8IWL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPA1Q8IWL2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPA1Q8IWL2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPA1Q8IWL2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms