Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERC1Q8IUD2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERC1Q8IUD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms