Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNL1Q8IU54 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNL1Q8IU54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms