Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM25Q86YD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM25Q86YD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM25Q86YD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM25Q86YD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM25Q86YD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms