Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCA5Q86VQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms