Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HAPLN4Q86UW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HAPLN4Q86UW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms