Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDF3Q7Z739 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms