Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KRT27Q7Z3Y8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT27Q7Z3Y8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms