Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYSMD3Q7Z3D4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LYSMD3Q7Z3D4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYSMD3Q7Z3D4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms