Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HS2ST1Q7LGA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS2ST1Q7LGA3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS2ST1Q7LGA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms