Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PAXIP1Q6ZW49 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXIP1Q6ZW49 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms