Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47EQ6ZV65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM47EQ6ZV65 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms