Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC55Q6ZSA7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC55Q6ZSA7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC55Q6ZSA7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms