Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREML4Q6UXN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREML4Q6UXN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms