Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf89Q6UWU4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf89Q6UWU4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf89Q6UWU4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms