Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNT2Q6UVM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNT2Q6UVM3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms