Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FIP1L1Q6UN15 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FIP1L1Q6UN15 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms