Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CASC1Q6TDU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASC1Q6TDU7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms