Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM220Q6QAJ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM220Q6QAJ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms