Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNV1Q6PIU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNV1Q6PIU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms