Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8BQ6P9F7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC8BQ6P9F7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC8BQ6P9F7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms