Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms