Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF544Q6NX49 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF544Q6NX49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF544Q6NX49 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms