Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms