Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDE2Q6IQ49 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms