Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPPQ6IPU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPPQ6IPU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms