Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPRIN2Q6IMN6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPRIN2Q6IMN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms