Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX8Q68G74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX8Q68G74 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms