Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH2Q5VUJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRCH2Q5VUJ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms