Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CEP350Q5VT06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CEP350Q5VT06 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CEP350Q5VT06 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms