Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKAP1Q5VSY0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKAP1Q5VSY0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms