Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO4Q5TGY1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms