Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPTPQ5TA50 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPTPQ5TA50 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CPTPQ5TA50 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms