Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYT6Q5T7P8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT6Q5T7P8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms