Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF648Q5T619 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF648Q5T619 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms