Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIF1Q5T3J3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRIF1Q5T3J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms