Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC122Q5T0U0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC122Q5T0U0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms