Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPATA46Q5T0L3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPATA46Q5T0L3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms