Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D4BQ5SQS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms