Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1LQ5PSV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms