Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVX7

C1orf141, Uncharacterized protein C1orf141, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf141Q5JVX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C1orf141Q5JVX7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C1orf141Q5JVX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf141Q5JVX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms