Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EFHC1Q5JVL4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHC1Q5JVL4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms